| Der Innenfilter ist eine weitere Methode in der Aquaristik, um das Aquarienwasser zu filtern; er findet sich oft in Aquarien-Komplettangeboten für Aquaristikanfänger.
Bei diesem Filtertyp befindet sich der gesamte Filter im Aquarium. Durch eine Ansaugöffnung wird das Wasser angesaugt, durch verschiedene Filtermaterialien gepumpt und strömt durch den Ausströmer zurück ins Becken. Auch bei dieser Art der Filterung ist der Hauptgrund der Benutzung weniger die Filterung von Schwebeteilchen oder sichtbaren Verunreinigungen, sondern der Abbau von Giftstoffen durch auf dem Filtermaterial lebende Mikroorganismen.
Der Innenfilter findet vor allem in kleinen und mittelgroßen Becken Verwendung. Ein Vorteil ist der meist geringere Preis im Verhältnis zum Außenfilter. Allerdings muß man eine deutliche optische Beeinträchtigung hinnehmen, da der komplette Filter im Becken zu sehen ist. Auch die in Abständen notwendige Filterreinigung gestaltet sich bei einem Innenfilter umständlicher.
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